【舞台設定】 あなたたちは国土交通省の指示に従って、いわゆる幽霊屋敷を調査し、現場に存在する霊の種類を特定し報告する事を業務とする“夜行鑑識(やこうかんしき)”だ。 ある屋敷の捜査中、期待の新人「馬川葵」が地下室で帰らぬ人となった…… 果たして、馬川を殺したのは霊なのか、それとも人間なのか。あなたたちは夜行鑑識としてこの謎を解き明かし、事件を解決しなければならない――