ゼンマイと歯車で動く人型の精密機械である『機巧人形（オートマトン）』と、それを作り出した人間が共存する世界。優秀な技術を持つエンジニアが集まるオートマトン研究所があった。そしてその研究所で、ある事件が起きた。この世界で初めてオートマトンを作った人物が殺され、そのパートナーのオートマトンまでも壊されていたのだ。重い空気が漂う中、誰からともなく話し合いが始まる。「「一体、誰がこんなことをしたんだ……？」」